Jean naît à Diest dans les Pays Bas espagnols le 3 mars 1599. Il est l’aîné de 5 enfants. 

À l’âge de 10 ans, sa maman tombe malade. Jean est envoyé à Malines au collège des jésuites où il découvre la vie de Louis de Gonzague, béatifié en 1605. Cela l’éclaire sur sa vocation : il veut devenir jésuite. Il fait le voyage à pied avec un autre futur novice pour rejoindre Rome. Il entre au noviciat en 1616, année de la mort de sa mère. 

En 1619, il entre au collège romain pour étudier la philosophie. C’est un étudiant très intelligent, serviable et qui mène une vraie vie mystique comme on le découvrira après sa mort avec son journal intime. 

Au début de 1621, sa santé décline, mais il passe brillamment ses examens finaux de philosophie début juillet. Mais peu après, il contracte la dysenterie et meurt le 13 aout à l’âge de 22 ans. On dit de lui que jamais, dans sa vie, il n’a commis de péché délibéré, ni enfreint quelque point de la règle ou quelque ordre de ses supérieurs.