Silvère est né au VIe siècle, probablement à Frosinone au sud de Rome. À la mort du pape Agapet Ier le 22 avril 536 à Constantinople, il est élu 58ème évêque de l’Église de Rome. Cette élection provoque une forte opposition car beaucoup considèrent qu’il occupe une fonction religieuse trop basse pour être digne d’accéder à la charge de pape : il est seulement sous-diacre. Mais il a été imposé par le roi ostrogoth Théodat qui menace d’exercer des représailles si son candidat n’est pas accepté. De son côté, l’impératrice Theodora fervente adepte de l’hérésie monophysite cherche à l’éliminer parce que Silvère refuse d’accepter le monophysisme, déjà condamné par le Concile de Chalcédoine en 451. Elle veut mettre à sa place un pape plus accommodant en la personne du diacre Virgile. Pour arriver à ses fins, elle utilise un général de l’armée byzantine nommé Belisaire qui est envoyé en Italie pour combattre les Ostrogoths. À la suite d’une accusation fausse, Silvère est dépouillé de ses vêtements pontificaux et envoyé en exil à Pataras, en Lycie. Le plan de Theodora fonctionne comme prévu : le diacre Virgile favorable au monophysisme est nommé pape à la place de Silvère. 

À Patras, l’évêque local enquête et arrive à prouver l’innocence de Silvère. L’empereur Justinien est obligé de libérer Silvère qui rentre à Rome. Virgile ne se laisse pas faire. Il obtient de Belisaire que Silvère soit envoyé de nouveau en exil, cette fois sur Palmorola, une petite île de l’archipel des Îles Pontines, dans la mer Tyrrhénienne. Sur cette île où il subit de nombreux mauvais traitements, Silvère décide de renoncer au pontificat, espérant ainsi préserver l’unité de l’Église. Il meurt un mois plus tard, le 2 décembre 537.