Du temps de saint François d’Assise, la petit chapelle de la Portioncule se trouve dans les bois au bas de la colline où est construite la ville d’Assise. Elle appartenait aux Bénédictins du Mont Subiaco qui l’ont donnée à François. Elle est très importante pour notre saint. C’est lui qui l’a restaurée. C’est autour de cette chapelle que s’est formée la communauté de ses premiers disciples. C’est là aussi qu’il a accueilli la future sainte Claire, désireuse de vivre selon les principes franciscains. Ce sera là enfin qu’il choisira plus tard de mourir. Aujourd’hui, cette chapelle est située dans l’imposante basilique de Sainte Marie des Anges à Assise. 

Dans ce lieu, une nuit de 1216, François est en prière. La Vierge Marie lui apparaît, assise à la droite de Jésus, et entourée d’anges d’où le nom qui sera donné à la basilique « sainte Marie des Anges ». François, brûlé du désir que tous les hommes soient sauvés, s’adresse à Jésus : « Seigneur, bien que je sois misérable et pécheur, je te prie d’accorder à tous ceux qui, repentis et confessés, viendront visiter cette église, un pardon ample et généreux, avec une rémission complète de toutes leurs fautes. » Jésus le renvoie vers le pape Honorius III qui accorde une indulgence plénière perpétuelle pour tous ceux qui viendront repentis à la Portioncule entre le 2 et 3 août de chaque année. L’Église a plus tard étendu ce privilège à toutes les églises franciscaines du monde entier. Ce privilège de miséricorde s’appelle « le pardon d’Assise », un cadeau que nous devons à saint François.